Село Ягодное было основано в 1741 году как русско-калмыцкое поселение. В конце 30-х годов XVIII века по инициативе В.Н. Татищева были основаны 11 слобод для переселения калмыков, крестившихся в православие, в том числе Воскресенская слобода, известная также как Ягодное. В 1744 году в Ягодном была построена деревянная церковь в честь Казанской иконы Божьей Матери. Строительство осуществляли русские крестьяне-поселенцы, бывшие монастырские крестьяне Савво-Сторожевого монастыря, на землях которого находилось село.
В 1774 году была возведена Воскресенская церковь. В 1855 году церковь подверглась ограблению: были похищены богослужебные сосуды, чаши, дискос, звездница, ложица и блюдо из позолоченного серебра. В 1870 году деревянная церковь была заменена каменной, а в 1883 году рядом была построена каменная часовня.
В 1770–1771 годах Екатерина II указом передала графам Орловым земли на волжских берегах, включая Воскресенскую слободу, что привело к образованию Ягодинского хутора Орловых, позднее Орловых-Давыдовых. С 1797 года крестьяне Ягодного находились в ведении удельного ведомства императорского дома. Они арендовали землю и отрабатывали оброк на различных работах, включая полевые и лесные.
В 1858–1859 годах была отменена личная зависимость крестьян, и с 1863 года они получили право выкупа земель в собственность, что осуществлялось с рассрочкой платежей на 49 лет. В 1868 году крестьяне Ягодного получили уставные грамоты.
Село Ягодное активно участвовало в событиях Отечественной войны 1812 года. Калмыки из Ягодинского улуса, сформированные в полк, сражались в составе второй русской армии под командованием П.Багратиона, отличившись в боях под Гродно и других сражениях.
В начале XX века Ягодное было крупным волостным селом с населением около 3418 человек. Село активно занималось хлебной торговлей, имело развитую инфраструктуру, включая школы и различные предприятия.
После установления советской власти в 1918 году церковь Воскресения Христова подверглась репрессиям: в 1922 году были изъяты церковные ценности, а в 1930 году колокола были сняты и переданы на переплавку. В 1935 году церковь была закрыта, а ее здание использовалось как зернохранилище.
В 2001 году было принято решение о строительстве нового храма. Проект был разработан фирмой "Инвест-Авто". Здание храма было спроектировано как единое целое с воскресной школой, что подчеркнуло важность образовательного аспекта в жизни общины. Храм и церковная лавка были открыты в центре села Ягодное, по улице Грачёва.
