Первое упоминание о церкви Воскресения Христова относится к 1493 году. В грамоте московского воеводы князя Ивана Юрьевича Патрикеева, адресованной его сыновьям, упоминается «церковь Воскресения, что на Грязех». Название связано с близостью храма к болотистому берегу Москвы-реки и весенними разливами. Впоследствии местность стала известна как село Кадашёво, а затем — Кадашёвская слобода.
В 1625 году в Патриарших окладных книгах появляются регулярные записи о храме. В 1656 году на месте деревянной церкви была построена первая каменная церковь, просуществовавшая около тридцати лет. От этой постройки сохранились южная апсида нижнего храма и каменный подклет-кладовая под алтарями.
В 1687 году началось строительство нового двухэтажного пятиглавого храма, завершившееся в 1695 году. Строительство финансировалось жителями Кадашёвской слободы, в частности, купцами Кондратом Марковичем Добрыниным и его сыном Лонгином Кондратовичем. Новый храм стал архитектурной доминантой Замоскворечья и определил градостроительную ось Москвы от колокольни Ивана Великого через церковь Воскресения в Кадашах к дворцовой церкви Вознесения в Коломенском.
Архитектурно храм представляет собой образец московского барокко. К высокому двусветному четверику с запада примыкает трапезная, окружённая на первом этаже обходными галереями. На втором этаже с северной и южной сторон расположены открытые галереи — гульбища. С востока находятся три двухэтажные апсиды с окнами. Четверик завершается пятью восьмигранными барабанами, увенчанными куполами в форме луковиц. С западной стороны пристроена шестиярусная колокольня высотой более 43 метров, частично выполненная из белого камня, частично — из кирпича. Фасады украшены белокаменной резьбой в виде виноградных лоз и листьев, наличники окон увенчаны многоступенчатыми гребнями, использованы витые колонки и карнизы из белого камня.
В храме четыре алтаря. Главный престол верхнего храма посвящён Воскресению Христову. Нижний храм имеет три престола: центральный — Успения Божией Матери, правый — Тихвинской иконе Божией Матери (освящён в 1704 году), левый — святителю Николаю Чудотворцу (освящён в 1772 году). Роспись стен и иконы были выполнены царскими изографами Петром Беляевым, Николаем Соломоновым, Петром Коробовым и Петром Билиндиным, учеником Симона Ушакова. В XVIII веке храм был известен богатой утварью и ризницей, включая золотой крест, украшенные жемчугом ризы и серебряное Евангелие весом около 13 кг.
В 1812 году, во время Отечественной войны, храм был разграблен французскими войсками. Пострадала роспись XVII века, значительная часть ценностей была утрачена, в нижнем храме была устроена конюшня. В 1848 году художник П. Н. Щепетов выполнил новую стенопись, а иконостас был заново позолочен. В 1860 году под руководством архитектора Н. И. Козловского были проведены строительные работы, в ходе которых древние стены галерей были разобраны и отнесены на 3,2 метра для расширения пространства.
В 1934 году храм был закрыт. В его стенах размещались различные государственные учреждения, включая архив КГБ и спортивный клуб колбасной фабрики. В середине XX века архитектор Гали Алфёрова провела реставрацию здания, и в 1966 году оно было передано Всероссийскому художественному научно-реставрационному центру имени И. Э. Грабаря.
В 1992 году был образован приход храма, а 1 декабря 2006 года подписан акт о его передаче Русской Православной Церкви. С тех пор продолжаются работы по восстановлению храма. В 2010 году попытки снести дом дьякона и некоторые близлежащие здания для строительства новостроек вызвали общественное сопротивление и получили широкое освещение в прессе под названием «Битва при Кадашах».
