В 1609 году село подверглось разорению со стороны польских отрядов, проходивших из Любима в Кострому.
Первое документальное упоминание о церкви в Сандогоре датируется 1703 годом, когда на погосте существовала деревянная шатровая церковь во имя Живоначальной Троицы с приделом Воскресения Христова. Колокольня имела четырехугольную форму с шатровым верхом.
В 1829 году на месте прежней деревянной церкви была возведена каменная пятикупольная церковь Троицы Живоначальной с двусветным основным объёмом, тёплой трапезной и колокольней. Строительство осуществлялось на средства прихожан и благотворителей. Главный престол храма освящён в честь Святой Живоначальной Троицы, а в тёплой трапезной расположены два придела: во имя святителя Николая и во имя преподобных Сергия Радонежского, Геннадия Костромского и Любимоградского, а также Феодосия Тотемского чудотворца.
Архитектурно храм представляет собой образец русской церковной архитектуры первой половины XIX века. Пятиглавый храм с двусветным основным объёмом и колокольней выполнен в традициях классицизма. Вокруг церкви была сооружена каменная ограда с воротами и калитками, украшенными фигурными филёнками и арочными завершениями. Металлические створки ворот и калиток по своему характеру близки к решёткам ограды.
