Инициатива строительства православного храма на территории 3-го Центрального военного клинического госпиталя имени А.А. Вишневского принадлежала начальнику госпиталя генерал-майору медицинской службы Юрию Викторовичу Немытину. Он обратился к священноначалию Русской Православной Церкви с просьбой о возведении церкви в честь святителя Луки (Войно-Ясенецкого), архиепископа Крымского, известного врача и духовного наставника.
28 июня 2002 года управляющий Московской епархией митрополит Крутицкий и Коломенский Ювеналий совершил чин основания храма. Строительство велось с учётом традиций православного зодчества, при этом учитывались особенности местности и функциональные потребности госпиталя.
18 октября 2012 года викарий Московской епархии архиепископ Можайский Григорий освятил храм. С этого момента храм стал духовным центром для пациентов и персонала госпиталя, а также для жителей посёлка Новый и окрестностей.
Архитектурно храм сочетает элементы византийского стиля, что придаёт ему величественный и одновременно гармоничный облик. Внутреннее убранство выполнено в традициях православной иконописи, создавая атмосферу духовного умиротворения.