Первое упоминание о Спасской церкви в Усть-Куте относится к 1699–1700 годам, когда в "Описной книге" зафиксировано наличие деревянного храма в Усть-Кутском остроге. В 1723 году, с расширением острога, была построена новая церковь внутри его территории. В 1743 году епископ Иркутский Иннокентий (Неронович) благословил прихожан на строительство новой церкви, которая была освящена в 1756 году епископом Софронием (Кристалевским). Однако в конце XVIII века этот храм сгорел.
В 1811 году была выстроена другая деревянная церковь – двухэтажная, с двумя престолами: верхний храм – в честь Спаса Нерукотворного Образа, нижний – во имя пророка Ильи. Этот храм сгорел в 1867 году. 19 июля 1869 года была освящена новая, однопрестольная деревянная церковь. К 1910 году приход церкви насчитывал 2357 человек. В 1930-х годах храм был снесён.
В 2006 году в районе речного порта города Усть-Кут было начато строительство нового храма в честь Спаса Нерукотворного Образа. На некоторое время работы были приостановлены, но летом 2009 года возобновились. В 2010 году возобновилась работа попечительского совета по строительству храма. 13 марта 2011 года в Усть-Куте был совершён молебен на освящение крестов строящегося храма. В результате пожара, произошедшего в ночь на 19 апреля 2013 года, была уничтожена кровля и повреждены стены строящегося храма на площади 40 кв. метров. Впоследствии храм был восстановлен и продолжил функционировать.
Храм представляет собой деревянное здание, соответствующее традициям русского православного зодчества. Архитектурные особенности включают в себя традиционные элементы, такие как срубная конструкция, двускатная крыша и наличие одного или нескольких куполов, увенчанных православными крестами. Интерьер храма оформлен в соответствии с канонами православной церкви, включая иконостас, аналои и другие литургические предметы.
