Первое упоминание о деревянной церкви Рождества Христова с приделом Владимирской иконы Божией Матери относится к 1628–1629 годам. Этот храм находился на месте современного Бабьего базара и обслуживал преимущественно казаков Александровской слободы. В 1730-х годах церковь сгорела и около 20 лет не восстанавливалась. В 1758 году жители слободы обратились с ходатайством о возобновлении храма, и в 1760 году была построена новая деревянная церковь. Однако 10 апреля 1769 года этот храм также сгорел во время большого пожара.
После пожара было принято решение о строительстве каменного храма. Строительство велось при священнике Тимофее Павлове на новом месте, в 200 саженях от прежней деревянной церкви. В 1770 году была завершена трапезная часть нового храма с приделом Тихвинской иконы Божией Матери, а в 1772 году освящен главный престол во имя Рождества Христова. К концу XVIII века к храму была пристроена каменная колокольня.
В середине XIX века возникла необходимость в перестройке храма из-за его ветхости и несоответствия новым архитектурным требованиям. В 1842 году был разработан проект перестройки, который предусматривал строительство нового храма на месте старого. Строительство началось в 1860 году и завершилось в 1869 году. В новом храме были освящены приделы: левый — во имя святого Пантелеймона в 1869 году, главный престол — во имя Спаса Нерукотворного образа 6 июня 1871 года, правый придел — в честь Воздвижения Животворящего Креста Господня 7 июня 1871 года.
Архитектурно храм представляет собой пятиглавую церковь в русско-византийском стиле с элементами классицизма. Кубовидный двусветный четверик завершен пятью куполами, фасады украшены пилястрами и полуколоннами, окна имеют полуциркульные завершения. Трехъярусная колокольня венчается восьмигранной луковичной главой.
После революции 1917 года храм Рождества Христова, как и многие другие религиозные учреждения, подвергся закрытию. В 1922 году из него были изъяты ценности, включая серебряную утварь. В последующие годы здание использовалось в качестве склада, что привело к утрате некоторых архитектурных элементов, включая четыре малые главки на храмовой части.
В начале 1990-х годов в храме находился реставрационный участок, однако попытки привести здание в порядок не увенчались успехом. В 2005 году храм был передан общине Знаменского женского монастыря, после чего начались восстановительные работы. Внутренние помещения были отреставрированы, установлены три иконостаса, промыты фрагменты сохранившихся росписей. В настоящее время храм является действующим, в нем регулярно проводятся богослужения.
