Храм Преображения Господня у Московских ворот был возведён в промышленном районе Санкт-Петербурга в конце XIX века. Инициатива строительства принадлежала обер-прокурору Святейшего Синода К.П. Победоносцеву. Городские власти выделили земельный участок, и 4 января 1895 года временная деревянная церковь, построенная по проекту архитектора М.Т. Преображенского, была освящена епископом Гдовским Назарием.
Закладка каменного двухэтажного храма состоялась 31 августа 1897 года. Строительство велось под руководством архитектора И.П. Володихина по проекту М.Т. Преображенского в русском стиле XVII века. Основным жертвователем выступил статский советник Е.Ф. Балясов. Храм был рассчитан на 2000 прихожан и увенчан девятью луковичными главами, с звонницей на главном куполе.
23 декабря 1901 года епископ Гдовский Константин освятил Успенский придел. 31 марта 1902 года епископ Ямбургский Сергий освятил придел Иоанна Крестителя. Главный престол был освящён 22 декабря 1902 года митрополитом Антонием (Вадковским) в сослужении с протоиереем Иоанном Кронштадтским. Иконостасы были выполнены из дуба по рисункам Преображенского, с иконами работы М.М. Васильева.
В 1902 году Иерусалимский Патриарх Герасим передал в храм список чтимой иконы Успения из Гефсиманского скита с частицами Гроба Божией Матери, Гроба Господня и Голгофы. При храме действовала школа, содержавшаяся приходским благотворительным обществом. В 1915 году в подвальном этаже был устроен придел блаженного Николая Юродивого в память о подвигах русских солдат в Первой мировой войне.
Храм был закрыт весной 1932 года и вскоре снесён. На его месте разбит сквер. Деревянная временная церковь, использовавшаяся после постройки каменного храма как зал Общества распространения религиозно-нравственного просвещения, также не сохранилась.