Храм Преображения Господня в селе Подкопаево Мещовского района Калужской области представляет собой кирпичную церковь, построенную после 1670 года, предположительно в 1688 году, по заказу боярина Фёдора Абрамовича Лопухина. Архитектурный облик храма выполнен в стиле «московского барокко»: двусветный кубический объём завершён двумя ярусами закомар и пятиглавием, с западной стороны к нему примыкает трапезная, с восточной — трёхчастная апсида. Изначально задумывался как соборный храм монастыря, который Лопухин планировал основать для перевода туда своей дочери, царицы Евдокии Фёдоровны, первой супруги Петра I.
В 1701 году рядом была возведена кирпичная надвратная церковь святителя Алексия, митрополита Московского, типа «иже под колоколы». Её архитектурная композиция включает кубический одноапсидный объём с восьмигранным столпом двухъярусной шатровой колокольни. Оба храма до 1820-х годов были обнесены каменной оградой, ныне утраченной. В XVIII веке усадьба принадлежала Лопухиным, в XIX веке перешла к помещику Н. Рюмину, а в 1910 году — к В. Н. Томановской.
В конце 1930-х годов храмы были закрыты и приспособлены под хозяйственные нужды: Преображенская церковь использовалась как склад и мастерские, Алексиевская — для хранения удобрений. В 1990-х годах оба храма переданы Калужской епархии. В ходе ремонтных работ в Преображенском храме обнаружен фрагмент белокаменного надгробия XVII века. В 2004 году освящён Преображенский храм, в 2009 году — Алексиевский. С 2008 года ансамбль функционирует как Спасо-Преображенский Алексиевский скит Свято-Георгиевского Мещовского монастыря.
Село Подкопаево (известное также как Спасское-Подкопаево или Преображенское) с середины XVII века принадлежало роду Лопухиных. Здесь родилась Прасковья Илларионовна Лопухина — будущая царица Евдокия Фёдоровна. По местным преданиям, не подтверждённым документально, царица некоторое время содержалась в основанном отцом монастыре, а царевич Алексей Петрович посещал её. Легенда о подземном ходе, ведущем к Георгиевскому монастырю в Мещовске, исторических свидетельств не имеет.
