Храм Покрова Пресвятой Богородицы в станице Холмской был сооружен в период с 1991 по 1993 год. Здание храма было обустроено в переоборудованном частном доме. Престол храма освящен в честь Покрова Пресвятой Богородицы. На момент постройки храм являлся единственным православным сооружением в станице.
Станица Холмская была основана в 1867 году на месте Хабльского лагеря, созданного азовскими казаками в 1863 году. В этот период здесь дислоцировался Абинский полк под командованием подполковника Фролова. В 1924 году станица вошла в состав Абинского района Кубанского округа. В 1961 году получила статус рабочего поселка под названием Холмский, который сохранялся до 1997 года, когда населенному пункту был возвращен прежний статус станицы.
Архитектурно храм представляет собой скромное строение без выраженных стилевых особенностей, характерное для храмов, создаваемых в перестроечный и постсоветский период. В 2013 году велось строительство надвратной колокольни, дополняющей храмовый комплекс. Транспортная доступность обеспечивается местными маршрутами №4 и №5.
Исторические источники не содержат сведений о наличии на территории станицы Холмской православных храмов в дореволюционный период. Современный храм был создан в ответ на духовные потребности возрождающейся церковной общины в 1990-е годы. В административном отношении храм относится к Абинскому благочинию Екатеринодарской и Кубанской епархии Русской Православной Церкви.
