Станица Ахтырская была основана в 1863 году запорожскими казаками — переселенцами Азовско-Черноморского казачьего войска. В соответствии с традициями казачьих поселений, строительство церкви началось одновременно с обустройством станицы. Первые богослужения проводились во временных помещениях.
Строительство каменного храма Рождества Пресвятой Богородицы началось в 1997 году и завершилось в 2007 году. Храм возведен на территории, исторически связанной с первыми казачьими поселенцами, о чем свидетельствует памятный знак при въезде на храмовую территорию.
Архитектурное решение храма соответствует традициям православного зодчества. В левой части иконостаса расположена икона Божией Матери «Ахтырская», получившая название по месту своего первоначального явления в селе Ахтырка Харьковской губернии в 1739 году. Рядом с иконой находится ковчежец с мощами святых угодников.
В храме хранятся мощи преподобных Лаврентия Черниговского, Серафима Саровского, Амвросия Оптинского, святителей Тихона Задонского и Игнатия Ростовского, а также других святых. Наличие этих святынь соответствует практике перенесения частиц мощей в новые храмы для их освящения.
При храме действует воскресная школа, где проводятся занятия по изучению Священного Писания, житий святых и основ православного вероучения. Библиотека прихода насчитывает более 1000 экземпляров книг религиозного содержания.