В середине XVIII века в селе Городище, находившемся на месте современного Ратмино, существовали две деревянные церкви, одна из которых была посвящена Похвале Пресвятой Богородицы. 15 июля 1823 года в результате удара молнии эта церковь сгорела. На её месте в 1824–1827 годах был построен каменный храм по проекту архитектора Доменико Жилярди. Во второй половине XIX века к храму были пристроены два придела: южный — в честь святителя Николая Мирликийского и северный — в честь пророка Илии. Рядом с храмом возвели двухъярусную колокольню.
С 1887 года при храме функционировала одноклассная церковно-приходская школа, рассчитанная на 50 учеников. В 1901 году к приходу относились деревни Ратмино и Козляки, а в 1915 году — также деревни Иваньково, Пекуново, Прислон и Притыкино.
В период с 1907 по 1914 годы храм подвергся реконструкции под руководством архитектора Юлия Дидерихса. Колокольня была достроена до третьего яруса и соединена с основным зданием храма. К колокольне пристроили ризницу и служебные помещения, что улучшило функциональность комплекса.
В 1930-е годы, в период гонений на церковь, храм был закрыт и разорён. Иконы были уничтожены, ценности разграблены, а внутреннее убранство разрушено. Священник Михаил Абрамов был арестован и расстрелян. В здании церкви разместили мастерскую по ремонту тракторов, клуб и столовую.
В 1988 году жители Дубны собрали около восьми тысяч подписей с просьбой вернуть храм верующим. Руководство Объединённого института ядерных исследований поддержало эту инициативу, и в 1989 году храм был передан Русской Православной Церкви. Восстановительные работы продолжались несколько лет, и 20 декабря 2009 года митрополит Ювеналий совершил чин великого освящения храма.
В настоящее время храм Похвалы Пресвятой Богородицы продолжает функционировать, являясь центром духовной жизни для жителей Дубны и окрестностей. При храме действует археологический музей, где представлены предметы, найденные во время раскопок на территории Ратминской стрелки. Ежегодно организуется детский летний лагерь, способствующий духовному и культурному воспитанию подрастающего поколения.
Архитектурно храм представляет собой образец русской церковной архитектуры XIX века с элементами классицизма. Основное здание украшено пилястрами и арочными окнами, придающими ему величественный и гармоничный облик. Колокольня, достроенная до третьего яруса в начале XX века, подчёркивает вертикальность композиции и служит важным акцентом в архитектурном ансамбле.
