Село Новое Еголдаево имеет богатую историю, восходящую к XVI веку. В результате военной реформы 1571 года правительство стало раздавать свободные земли помещикам, что привело к основанию поселений служилых людей. Первое упоминание о слободе Еголдаева относится к 1573 году. Впоследствии, после разрушения слободы в 1581 году в результате набега Крымского хана, поселение было восстановлено. В окладных книгах 1676 года село Еголдаево упоминается с церковью во имя Святителя Николая Чудотворца.
Существующий каменный храм был построен в 1838 году на средства помещицы Елисаветы Петровны Арсеньевой. Колокольня храма была начата в 1849 году и завершена в 1853 году. В 1877 году были устроены приделы в честь Покрова Пресвятой Богородицы и Преподобного Сергия Радонежского. Архитектурно храм представляет собой образец церковного зодчества XIX века с характерными для того времени элементами.
В 1845 году при храме была открыта церковно-приходская школа, располагавшаяся в доме наставника священника М.А. Колюмбова и содержавшаяся на средства палаты государственного имущества. В 1866 году в школе обучалось 58 мальчиков и 1 девочка. Позднее, уездным предводителем дворянства С.С. Норманном было основано одноклассное земское училище, размещавшееся в одноэтажном деревянном здании. В 1895 году в селе была открыта церковно-приходская школа, обучавшая 27 учащихся.
В советский период, в 1930-х годах, храм был закрыт, а его здание использовалось не по назначению. Колокольня была разрушена, внутреннее убранство храма утрачено. Здание находилось в запущенном состоянии на протяжении нескольких десятилетий.
С конца 1990-х годов начались работы по восстановлению храма. С 2006 года, при активном участии местных жителей и прихожан, проводятся реставрационные работы, включая восстановление купола, внутреннего убранства и благоустройство прилегающей территории. В настоящее время храм является действующим, в нем регулярно проводятся богослужения и осуществляется духовное окормление прихожан.
