Первоначально на месте современного села существовала Вознесенская часовня, где 7 июля 1702 года была явлена икона святителя Николая Чудотворца. Согласно преданию, в доме вдовы Саломеи Прокопьевой её сын, Григорий Рожнёв, тяжело болел и неожиданно исцелился после явления иконы святителя Николая. Это событие стало основой для установления ежегодного крестного хода с чудотворной иконой из Семилужек в Томск, что привлекло множество паломников в эти места.
В 1818 году в селе была построена каменная церковь во имя Вознесения Христова, которая имела два придела: летний, холодный — в честь Вознесения Господня, и зимний, отапливаемый — в честь святителя Николая Чудотворца. В 1862 году к храму был пристроен придел во имя Казанской иконы Божией Матери. Архитектурно церковь была выполнена в стиле барокко, что отражало традиции того времени.
В советский период, в 1936 году, храм был закрыт, и его имущество конфисковано. Здание использовалось для различных хозяйственных нужд, а со временем пришло в упадок. Последним настоятелем храма был игумен Серафим Скорняков, судьба которого после ареста неизвестна.
В 2001 году, благодаря усилиям местных жителей и поддержке епархии, в селе была оборудована новая церковь святителя Николая Чудотворца в переоборудованном недостроенном жилом доме. Освящение храма состоялось 9 декабря 2001 года епископом Томским и Асиновским Ростиславом.
В 2011 году архиепископ Томский и Асиновский Ростислав совершил закладку нового храма в честь святителя Николая Чудотворца и страстотерпца царя Николая на территории Семилуженского казачьего острога, воссозданного как культурно-исторический объект.
