В 1877 году на средства пароходного общества «Дружина» в Звенигово была построена первая деревянная церковь во имя святителя Николая Чудотворца. Внутреннее убранство храма было приобретено на пожертвования рабочих Звениговского затона. Изначально церковь была приписана к Троицкому храму села Красный Яр, но после 1901 года стала самостоятельным приходом.
В 1910 году, после того как деревянная церковь сгорела, на ее месте был возведен новый каменный храм. При храме функционировало одноклассное училище, где в 1904 году обучались 50 мальчиков и 38 девочек.
В 1931 году советские власти закрыли храм. В период Великой Отечественной войны здание использовалось как казарма для новобранцев перед отправкой на фронт. В 1950-е годы в храме разместился Дом пионеров.
В 1990 году храм был передан верующим, и начались работы по его восстановлению. С апреля 2014 года настоятелем храма является иерей Антоний Блинов. При приходе работают воскресная школа для детей и взрослых, библейский кружок, проводятся различные массовые мероприятия.
Архитектура церкви представляет собой каменное здание в стиле позднего классицизма. Основной объем храма является параллелепипедом, к которому с востока и запада примыкают алтарь и трапезная. С запада расположена массивная колокольня. Фасады украшены пилястрами и профилированными карнизами, придающими зданию строгость и величие.
