Первое упоминание о населённом пункте Гаврилова Гора датируется 1571 годом, когда он входил в состав Быстреевского погоста. Археологические исследования, проведённые в 1991 году, выявили следы поселения XV—XVII веков.
Современное здание церкви было возведено в 1770 году. Архитектурно храм представляет собой деревянное сооружение, характерное для северо-западных регионов России того периода. Он состоит из основного объёма с алтарной частью и притвором, а также колокольни, расположенной над западным входом. Фасады храма украшены резными элементами, отражающими традиции народного зодчества.
В течение своей истории церковь Святителя Николая Чудотворца продолжала функционировать, несмотря на различные исторические события. Во время Великой Отечественной войны и последующего советского периода храм не прекращал свою деятельность, сохраняя религиозные традиции местного населения.
В 1995 году церковь была включена в список объектов культурного наследия федерального значения, что подчёркивает её историческую и архитектурную ценность. На сегодняшний день храм продолжает действовать, являясь центром духовной жизни деревни Гаврилова Гора и окрестных населённых пунктов.
