История православного прихода в селе Старые Зятцы восходит к середине XVIII века. Около 1751 года был открыт Старозятцинский приход, и в 1756 году построена первая деревянная церковь, состоявшая из тёплой и холодной частей с прирубленным шестиугольным алтарём. Холодная церковь была освящена 12 декабря 1762 года в честь Рождества Христова, а тёплая — 20 декабря 1785 года в честь Архангела Михаила. С 1826 по 1863 год, в период утраты селом статуса, деревня была приписана к приходу села Узи. Богослужения возобновились в старой деревянной Христорождественской церкви после возвращения статуса села.
26 сентября 1863 года было начато строительство новой деревянной церкви, освящённой 3 октября 1865 года во имя Введения Пресвятой Богородицы. В 1866 году, после завершения строительства, старая Христорождественская церковь была перенесена на кладбище и обращена в часовню. Однако 15 июня 1878 года Введенско-Богородицкая церковь сгорела. Старая Христорождественская церковь была отремонтирована и вновь освящена 16 июля 1878 года, использовалась до освящения каменного храма 28 сентября 1878 года.
Строительство каменного храма было начато по указу от 31 января 1874 года. Церковь была построена на средства елабужского купца Фёдора Григорьевича Чернова и прихожан. Правый придел церкви был освящён 28 сентября 1878 года в честь Святых Афанасия и Кирилла Александрийских. Первоначально церковь получила название Афанасие-Кирилловской, но 11 ноября 1893 года была переименована в Казанско-Богородицкую, так как в честь Казанской иконы Божией Матери был освящён главный — средний — придел церкви. Левый придел был освящён 14 ноября 1895 года в честь Великомученицы Параскевы. Христорождественская церковь стала приписной кладбищенской церковью при Казанско-Богородицкой. Казанско-Богородицкая церковь была закрыта 10 августа 1938 года.
По просьбам верующих села и близлежащих деревень, 30 сентября 1992 года в доме, где ранее проживал местный протоиерей Михаил Иванович Шерстенников, был открыт молитвенный дом. Этот дом находится через дорогу от бывшего храма. На открытии молитвенного дома присутствовали жители Старых Зятц и округи, прихожане из соседнего Игринского района и работники местной районной газеты.
