Первая деревянная церковь в селе Латное была построена в 1863 году и освящена в честь Казанской иконы Божией Матери. С течением времени, в связи с увеличением числа прихожан и необходимостью более прочного сооружения, было принято решение о строительстве нового храма.
15 сентября 1896 года состоялась закладка нового кирпичного храма, приуроченная к коронации императора Николая II. Проект был разработан воронежским губернским архитектором А. А. Кюи. Строительство велось в соответствии с канонами православного храмового зодчества того времени. 22 августа 1905 года храм был освящён во имя Казанской иконы Божией Матери. Внутри храма были устроены два придельных алтаря: в честь святителя Николая и святых апостолов Петра и Павла. Рядом с храмом была построена двухэтажная приходская школа.
В советский период храм был закрыт. В 1930-х годах предпринимались попытки его разрушения, однако прочные кирпичные стены устояли. Перед Великой Отечественной войной стена храма использовалась как экран для показа кинофильмов. Во время оккупации села немецкими войсками в 1942 году церковь не была разрушена, и в ней разрешалось проводить богослужения. После войны здание храма постепенно разбиралось: были демонтированы стены, снято железное покрытие крыши, сорваны иконы.
В 1990-х годах началось восстановление храма усилиями местных жителей. Был организован приходской совет, и храм был возвращён Воронежской епархии. В настоящее время в храме регулярно проводятся богослужения, продолжаются работы по его восстановлению.
Постановлением администрации Воронежской области № 850 от 14 августа 1995 года церковь Казанской иконы Божией Матери в селе Латное признана объектом исторического и культурного наследия областного значения.
