Село Комарье основано в конце XIX века и с самого начала своего существования стало центром сельской общины. В начале XX века, учитывая рост населения и укрепление православных традиций, возникла необходимость в возведении нового храма. В 1910 году по инициативе местных жителей и благословению священнослужителей началось строительство каменного храма в честь Казанской иконы Божией Матери. Архитектурный проект был разработан с учётом традиций русской церковной архитектуры, что обеспечивало гармоничное сочетание с окружающим ландшафтом.
Открытие храма состоялось в 1912 году, и с этого момента он стал центром духовной жизни местного населения. Регулярные богослужения, обряды и праздники привлекали верующих из окрестных деревень, способствуя укреплению общинных связей и сохранению традиций.
В советский период, начиная с 1920-х годов, церковь подверглась значительным изменениям. В условиях проводимой политики секуляризации и антирелигиозных кампаний храм был закрыт, а его здание использовалось для нужд сельского хозяйства. Иконы и церковная утварь были изъяты, а внутреннее убранство изменено в соответствии с новыми функциями помещения.
В послевоенные годы, с 1945 по 1980-е годы, здание храма продолжало использоваться не по назначению. Однако к концу 1980-х годов наблюдался рост интереса к духовному наследию, что привело к инициативе по возвращению храма общине. В 1991 году, после проведения реставрационных работ, храм был вновь открыт для проведения богослужений.
В постсоветский период храм Казанской иконы Божией Матери стал важным центром не только религиозной жизни. Проводимые при нём выставки, концерты и образовательные программы способствовали возрождению традиций и укреплению общинных связей.
Архитектурно-художественная ценность храма была признана на государственном уровне. В 2000 году здание было включено в список объектов культурного наследия регионального значения. Проведённые реставрационные работы позволили сохранить уникальные элементы интерьера и экстерьера, отражающие исторический облик сооружения.
На рубеже тысячелетий храм продолжал выполнять свою основную функцию — быть местом молитвы и духовного общения. Он активно сотрудничает с местными образовательными учреждениями, проводя уроки по изучению истории православия и духовных традиций. Кроме того, храм участвует в благотворительных проектах.