В 1911 году в селе Улаган была построена деревянная церковь в честь Казанской иконы Божией Матери. Строительство храма стало результатом миссионерской деятельности Русской Православной Церкви в регионе, направленной на распространение православия среди местного населения. Возведение храма способствовало укреплению православной общины и духовному развитию села.
В советский период, в середине XX века, храм был упразднён. Основной сруб церкви был разобран и перенесён на новое место. Это было обусловлено государственной политикой секуляризации и ограничением религиозной деятельности в стране. Здание храма использовалось в иных целях, не связанных с религиозной практикой.
В 2002 году в селе Улаган была восстановлена православная община, и началось возрождение храма. Молитвенный дом был построен частично из бревен старого храма, сохранив преемственность с историческим зданием. С 2005 года началось строительство новой деревянной церкви типа восьмерик на четверике с колокольней. Архитектурный стиль храма соответствует традиционному русскому деревянному зодчеству, характерному для православных храмов Сибири и Алтая.