Строительство каменного храма началось в 1858 году и продолжалось до 1872 года. Село Никулята, ранее известное как Верхоижское, находилось на расстоянии 182 верст от города Вятки и 37 верст от уездного города. Церковь была построена взамен деревянного храма, перевезённого из села Боровицкого и отстроенного в 1849 году с двумя престолами: в холодном храме – во славу Богоявления Господня. Новый каменный храм был освящён в 1872 году.
Архитектура церкви отражает традиции классицизма с элементами эклектики. Внутреннее убранство сохранило значительную часть настенной живописи, выполненной в 1863 и 1882 годах.
В 1878 году была построена деревянная часовня Яморская, расположенная в 60 верстах от села. Церковь и часовня служили центрами духовной жизни местного населения, поддерживая традиции и укрепляя общинные связи.
В советский период, с 1920-х годов, церковь, как и многие другие религиозные учреждения, подвергалась репрессиям и ограничениям. Однако, несмотря на трудности, храм продолжал функционировать, поддерживая духовные потребности местного населения.
В послевоенные годы церковь пережила периоды запустения и восстановления. В 2003 году была зарегистрирована местная православная религиозная организация «Приход храма Казанской иконы Божией Матери села Никулята Яранской епархии».