Первые упоминания о православной общине в селе Богдашкино относятся к середине XVIII века, когда часть местных жителей, преимущественно чувашей, приняла крещение во времена царствования Елизаветы Петровны. Вторая волна крещения произошла при Екатерине II, однако население встречало новую веру с сопротивлением, что побудило духовенство организовать богослужения на родном языке.
В 1888-1889 годах было построено первое здание школы-церкви, освященное 28 декабря 1890 года. Храм функционировал как двухклассная школа с церковным приделом, где первым священником стал И.С. Бюргановский. Инициатива строительства принадлежала чувашскому просветителю И.Я. Яковлеву, при поддержке которого к зданию добавили пристрой с двумя куполами и колокольней.
В 1930-х годах храм был закрыт, как и большинство церквей в СССР. Здание утратило культовое назначение на несколько десятилетий. Возрождение приходской жизни началось в XXI веке: 16 августа 2014 года митрополит Симбирский и Новоспасский Феофан освятил крест и купола нового храма, строившегося на месте исторической церкви.
13 июля 2015 года приход был официально зарегистрирован как местная религиозная организация. Архитектурный облик современного храма воспроизводит традиционные формы православного зодчества. При храме действует источник, освященный в честь Казанской иконы Божией Матери, с часовней и купелью, куда ежегодно совершается крестный ход с Жадовской иконой.
Село Богдашкино, основанное в 1662 году служилым чувашом Богдашкой Ахтеевым, исторически отличалось многонациональным составом населения. Православная община сосуществовала с мусульманской, о чем свидетельствует наличие в селе как церкви, так и мечети. В дореволюционный период между группами населения периодически возникали конфликты на религиозной почве.