Село Бишево основано в период Казанского ханства и впервые упоминается в письменных источниках в 1646 году. С момента основания села в нём существовала православная община, что обусловило необходимость строительства храма для обеспечивания духовного окормления местных жителей.
В 1894 году на средства прихожан была построена деревянная церковь, освящённая в честь обретения главы святого пророка, Предтечи и Крестителя Господня Иоанна. Храм имел два престола: главный — в честь обретения главы Иоанна Предтечи, и боковой придел — во имя Архистратига Божия Михаила. Архитектурно церковь представляла собой традиционное деревянное здание с характерными для того времени элементами русского церковного зодчества.
Приход храма включал несколько населённых пунктов, среди которых были деревни Новопоселённые Биабаши, Табарь-Черки, Булым-Булыхчи, Девликеевка, Деушева, Мурзина, Апастова, Эбалакова, Куштова и Бакарчи. Общее число прихожан составляло 3508 человек, объединённых в 422 двора. Кроме того, в селе функционировала земская школа.
В 1931 году, в период активной антирелигиозной политики советского государства, храм был закрыт. Здание церкви использовалось для различных хозяйственных нужд: первоначально в нём разместили клуб, затем в годы Великой Отечественной войны — склад строительных материалов, а позже — зернохранилище. В 1950 году купола храма были снесены, и в его стенах разместилась средняя школа, которая функционировала до 1997 года.
В конце 1990-х годов местные жители инициировали процесс восстановления храма. Строительство нового каменного здания началось в 2006 году и продолжалось более десяти лет. В 2022 году, по благословению митрополита Казанского и Татарстанского Кирилла, храм был освящён архиерейским чином, что ознаменовало возрождение духовной жизни в селе.
