Храм во имя святого апостола и евангелиста Иоанна Богослова в селе Вагай Тюменской области относится к числу памятников церковной архитектуры Сибири. Первые упоминания о деревянной церкви в Вагае встречаются в документах XVII века, когда данный регион активно осваивался русскими переселенцами. Каменное здание храма было возведено в середине XIX века на средства местных купцов и крестьян.
Архитектурный облик храма характерен для провинциального церковного зодчества указанного периода. Здание выполнено в традициях позднего классицизма с элементами русско-византийского стиля. Основной объем представляет собой четверик, увенчанный восьмигранным световым барабаном с луковичной главкой. С запада к храму примыкает трапезная часть, завершенная колокольней в три яруса.
В документах епархиального ведомства за 1897 год храм числится как действующий, при нем имелась церковно-приходская школа. В период с 1930 по 1945 годы здание использовалось в хозяйственных целях. Богослужебная деятельность была возобновлена в послевоенный период. В 1960-е годы храм избежал закрытия благодаря ходатайствам верующих.
Реставрационные работы проводились в 1980-х и 2000-х годах. В ходе них были восстановлены утраченные элементы декора фасадов, проведена реконструкция иконостаса. В храме сохранились несколько икон XIX века, включая образ святого апостола Иоанна Богослова в серебряном окладе.
Приход храма входит в состав Тобольско-Тюменской епархии Русской Православной Церкви. В настоящее время здание признано объектом культурного наследия регионального значения. Архивные документы, касающиеся истории храма, хранятся в Государственном архиве Тюменской области.