Село Черное основано в 1666 году как острог Адбажская слобода. В начале XVIII века на этом месте была возведена часовня, позже преобразованная в поселение с лекарской избой. Первый деревянный храм во имя Святой Троицы построен в 1816 году на средства прихожан. Храм имел один престол, освященный в честь Троицы Живоначальной.
В 1932 году священнослужитель храма был арестован, а здание переоборудовано под клуб, затем под продовольственный склад. Колокольня демонтирована жителями деревни Плесовской, использовавшими бревна для строительства домов. К 1982 году заброшенное здание храма полностью разобрано местными жителями на дрова, а место его расположения выровнено.
В 1991 году Управляющий Тобольско-Тюменской епархией совершил визит в село Черное, проведя крещение около ста человек в здании клуба. В том же году образован Приходской совет, получивший в дар от сельского потребительского общества каменное здание магазина для организации молитвенного дома.
В 2003 году по инициативе прихожан начата подготовка к строительству нового деревянного храма. Черновское лесничество выделило сто кубометров леса, силами местных жителей за лето 2004 года выполнен сруб. Весной 2004 года состоялось освящение закладного камня и заливка фундамента. Основные строительные работы завершены к 2006 году, когда в храме начали совершаться регулярные богослужения.
В 2007 году приобретена малая звонница на пожертвования прихожан. В 2008 году установлен иконостас, изготовленный клиросными служителями тюменского храма Архангела Михаила. С 2010 года в храме совершается ежегодное празднование престольного праздника - дня Святой Троицы, собирающее прихожан из окрестных селений.