Село Белоярское было основано в 1682 году тремя братьями Согриными, бежавшими каторжанами. В 1771 году в селе была построена деревянная церковь во имя святых Флора и Лавра. Однако она простояла недолго и была уничтожена пожаром. После этого жители села приняли решение о строительстве нового каменного храма на возвышенном месте в центре села. Для сбора необходимых средств они обратились за помощью к жителям окрестных деревень: Косулино, Куликово, Пивкино, Красноярка и Чесноки. Строительство началось в 1810 году и к 1812 году здание было возведено до уровня окон. Колокола для церкви были отлиты непосредственно в Белоярском, самый большой из них весил 120 пудов (около 1,9 тонны).
К 1833 году строительство храма было завершено. Церковь представляет собой величественное двухсветное здание, выполненное в стиле уральского барокко, с шатровым пятиглавым завершением. Стройная ярусная колокольня, построенная в едином ансамбле с трапезной, до 1933 года радовала сельчан благозвучным колокольным звоном. В интерьере храма сохранились кованые решетки окон и козырек над южным входом.
В 1869–1872 годах храм подвергся реконструкции и перестройке, в ходе которых были внесены некоторые изменения в его архитектурный облик.
В 1933 году, в период антирелигиозной политики советской власти, церковь была закрыта. В 1935 году были демонтированы колокола, включая самый большой, весом 120 пудов. После закрытия здание храма использовалось под различные хозяйственные нужды, что привело к его постепенному разрушению.
В 1990-х годах, после изменения государственной политики в отношении религии, храм был возвращен верующим. Силами местных жителей и при поддержке Шадринской епархии начались реставрационные работы. 17 июля 2014 года отремонтированный храм был вновь освящен, и в нем возобновились богослужения.
