История этого храма охватывает период с середины XIX века до настоящего времени и отражает как духовные устремления местных жителей, так и исторические события, повлиявшие на судьбу религиозных сооружений в России.
Строительство каменного храма в селе Пивкино было инициировано местными прихожанами, осознававшими необходимость создания постоянного места для богослужений. По данным, предоставленным сельчанами, церковь была построена в 1861 году и была рассчитана на 400 человек. Архитектурно здание представляло собой традиционный для того времени храм, выполненный из красного кирпича, что придавало ему величественный вид.
После Октябрьской революции 1917 года и установления советской власти многие религиозные учреждения в стране подверглись закрытию или перепрофилированию. Храм Святителя Николая Чудотворца в Пивкино не стал исключением. В 1928 году церковь была закрыта, и её помещения использовались для хранения зерна. Несмотря на длительное запустение, здание храма сохранило свою структуру, хотя и находилось в неудовлетворительном состоянии.
К началу XXI века здание храма находилось в полуразрушенном состоянии. В 2009 году местный предприниматель Сергей Басков инициировал восстановительные работы, направленные на реставрацию храма и возвращение ему первоначального облика.
15 сентября 2011 года архиепископ Курганский и Шадринский Константин в ходе рабочей поездки по Западному благочинию совершил молебен в храме Святителя Николая в селе Пивкино. К 2012 году основные реставрационные работы были завершены, что позволило возобновить богослужения. 30 декабря 2012 года архиепископ Константин возглавил великое освящение храма Святителя Николая в селе Пивкино.
