Строительство храма связано с восстановлением духовной жизни на Малой Охте и увековечением памяти о ранее существовавшем здесь храме.
В 1781 году на Малой Охте была возведена каменная церковь во имя святой Марии Магдалины, ставшая важным духовным центром для местных жителей. В 1849–1857 годах храм был значительно перестроен по проекту архитекторов В.Ф. Небольсина и К.Я. Маевского: расширены помещения, возведены новая колокольня и купол, устроены два придела — во имя святого Иоанна Златоуста и святого Георгия Владимирского.
При храме действовали благотворительные учреждения, включая богадельню и приходские школы. В 1913 году местные жители увековечили память писателя Н.Г. Помяловского, сына дьякона этой церкви, назвав улицу у кладбища его именем.
В 1938 году церковь была закрыта, здание использовалось под кинотеатр, а в 1960-х годах окончательно снесено. Малоохтинское кладбище, расположенное рядом с храмом, также было уничтожено в советский период.
В 1996 году на месте разрушенного храма началось строительство нового храма Успения Пресвятой Богородицы, освящённого в 2001 году. Она была возведена недалеко от места, где ранее находилась церковь, и освящена в честь святой равноапостольной Марии Магдалины.
Архитектурно часовня выполнена в традиционном стиле, гармонирующем с окружающей застройкой. Её строительство стало возможным благодаря усилиям местной общины и поддержке церковных властей. Часовня стала символом возрождения духовной жизни на Малой Охте и напоминанием о богатом историческом наследии этого района.
