Село Березники известно с XV века, когда великий князь литовский Казимир пожаловал «Ходку Малому у Рылску Березники». В 1626 году в Березниках впервые упоминается церковь во имя святых мучеников Бориса и Глеба. В 80-х годах XVII века в селе действовали две церкви: Борисоглебская и Ильинская.
В 1699 году было начато строительство нового каменного храма Бориса и Глеба, которое продолжалось до 1707 года. Церковь была построена на средства местных помещиц, сестер Анны и Прасковьи Мещерских, и освящена в 1707 году. Архитектурно храм представлял собой однопрестольное здание с трапезной и колокольней.
В 1876 году, учитывая ветхость предыдущего строения, было принято решение о возведении нового каменного храма. Строительство велось на средства прихожан и местных помещиц. Храм был освящен в 1876 году. Архитектурно он был выполнен в стиле русской архитектуры XIX века с характерными элементами, такими как купола и кресты.
В советский период, в 1930-е годы, храм был закрыт, а здание использовалось под склад. Колокольня была разрушена, а внутреннее убранство утрачено. В послевоенные годы здание постепенно разрушалось.
В 1990 году местные жители обратились к властям с просьбой вернуть здание церкви для проведения богослужений. В 1992 году храм был передан общине, и начались работы по восстановлению. Были восстановлены купола, кровля и фасад. В 1995 году храм был освящен и открыт для прихожан.
