Этот каменный храм заменил прежнюю деревянную церковь, дата строительства которой неизвестна.Первоначально храм имел два престола: главный — в честь Богоявления Господня, и придельный в трапезной части — во имя святителя Николая Чудотворца.
В 1855 году, ввиду недостаточной вместимости трапезной, была проведена её реконструкция: правый придел святителя Николая Чудотворца перестроен, а с левой стороны добавлен новый придел во имя святого великомученика Георгия Победоносца. Эти работы финансировались за счёт средств церкви и пожертвований прихожан.
К концу XIX века приход храма включал несколько населённых пунктов: село Хрущёво-Богоявленское, деревни Протопопово, Банино, Барсуки, Малые Барсуки и Барсуковские Выселки, с общим населением около 4050 человек. Жители занимались земледелием, а также ремёслами: слесарным, самоварным, кровельным, малярным, изготовлением лубяных коробов и решет.
При храме функционировали церковно-приходское попечительство, основанное в 1867 году, земская народная школа и с 1895 года — церковно-приходская школа, располагавшаяся на церковной земле в деревянном здании.
В советский период храм был закрыт, и его здание использовалось под различные нужды, что привело к утрате части архитектурных элементов и внутреннего убранства.