Первоначальное строительство храма относится к 1698 году, когда в слободе Борисовка была возведена деревянная церковь в честь Архистратига Михаила. Освящение храма было связано с воспоминанием чуда Архистратига Михаила, произошедшего в Хонех. В 1744 году деревянная церковь была перестроена.
К началу XIX века здание обветшало, и 29 мая 1804 года рядом с прежним храмом была заложена каменная церковь по проекту архитектора Масалова. Строительство велось на средства прихожан и завершилось в 1811 году. Храм был освящен 21 августа 1811 года в честь Собора Архистратига Михаила и прочих Небесных Сил бесплотных.
В 1865–1867 годах, в связи с увеличением числа прихожан, храм был расширен: к нему были пристроены трапезная часть и колокольня. В 1872 году на колокольне были установлены часы с курантами, изготовленные борисовским мастером Василием Семеновичем Безсаловым. В 1894 году к 106-пудовому колоколу был добавлен новый 306-пудовый, отлитый на Валдае.
В 1911 году, спустя сто лет после освящения каменного храма, деревянный иконостас был заменен мраморным. Новый иконостас, выполненный мастерами харьковской фабрики Соммавила, является уникальным и единственным по своему исполнению в Белгородской митрополии. Он изготовлен из мрамора двух цветов — белого с голубыми прожилками и красно-коричневого, и украшен мелким кружевом искусной резьбы. На иконостасе сохранилась надпись, указывающая на его сооружение в память Священного коронования императорских величеств Николая II и Александры Федоровны.
В советский период храм был закрыт, его помещение использовалось в качестве склада, а во время Великой Отечественной войны — для содержания военнопленных. В 1943 году храм был вновь открыт, и в нем возобновились богослужения.
В настоящее время в храме освящены три престола: главный — в честь Собора Архистратига Михаила и прочих Небесных Сил бесплотных, второй — во имя Святителя Димитрия Ростовского и третий — в честь праздника Покрова Божией Матери.
В период с 2007 по 2016 годы были проведены реставрационные работы по сохранению объекта культурного наследия. В ходе работ были восстановлены кирпичные кладки оконных проемов, стен, полуколонн, аттики, а также произведена реставрация лицевой поверхности наружных стен. Была проведена замена кровли, включая устройство новых мауэрлатов, прогонов, подкосов, стоек из хвойного бруса, обрешетки скатной крыши и покрытие крыши оцинкованной сталью. Также были заменены дверные и оконные коробки, наличники, подоконные доски, установлены новые дверные и оконные петли.
