Существующие данные свидетельствуют о наличии в селе деревянного храма в честь святителя Николая Чудотворца уже во второй половине XVII века.Об этом свидетельствует надпись на пожертвованном кресте: «Лета 7193 генваря в 16 день дарован сей животворящий крест в Суздальский уезд в село Бородино в церковь Николаю Чудотворцу Бородинскому»
В 1827 году на средства помещика Николая Александровича Бутурлина и местных крестьян был возведён каменный храм в честь Архангела Михаила. Строительство осуществлялось в стиле классицизма, характерном для того периода. Храм имеет план в форме латинского креста с центральным кубообразным объёмом, завершённым купольной ротондой с люкарнами и вазообразной главкой на гранёном барабане. К основному объёму примыкают полуциркульная апсида, боковые ризалиты и трапезная. С западной стороны композицию замыкает трёхъярусная колокольня, завершённая главкой-вазоном. Фасады украшены чередующимися окнами, пилястрами и полуколоннами, а также фронтонными портиками над боковыми входами. Декор включает карнизы, пояски и аттики, выполненные в белом камне .
В 1867 году рядом с храмом была построена зимняя (тёплая) церковь в честь иконы Божией Матери «Неопалимая Купина» на средства прихожан и помещика Бутурлина. В 1878 году в этой церкви был устроен придел во имя Спаса Нерукотворного Образа. Здание выполнено в традициях позднего классицизма с элементами эклектики. Фасады украшены сдвоенными пилястрами, наличниками с килевидными архивольтами и треугольными фронтонами. Внутреннее пространство перекрыто системой крестовых сводов, поддерживаемых двумя столпами .
После революции 1917 года церковная жизнь в селе Бородино претерпела изменения. В 1937 году обе церкви были закрыты. До 1946 года храм Архангела Михаила использовался в качестве склада. 27 мая 1946 года между местными властями и православной общиной был заключён договор, после чего в храме возобновились богослужения. С того времени храм не закрывался, однако реставрационные работы не проводились до 2010-х годов .
В 2010-х годах храм Архангела Михаила был капитально отреставрирован. В настоящее время он является действующим православным храмом, в котором регулярно совершаются богослужения. Храмовый комплекс, включающий также церковь иконы Божией Матери «Неопалимая Купина», расположен на ровной площади в северной части села, у дороги, по другую сторону которой находится пруд. Комплекс доминирует в застройке и хорошо виден с шоссе .
