Он входит в состав Даниловского благочиния Московской городской епархии Русской Православной Церкви.
История православного присутствия в Братееве восходит к XVII веку, когда в селе существовала деревянная церковь Усекновения главы Иоанна Предтечи с приделом Архангела Михаила. В 1890 году на высоком берегу Москвы-реки была заложена новая каменная церковь в византийском стиле с тремя престолами: главным во имя Иоанна Предтечи, северным — во имя Архангела Михаила и южным — во имя священномученика Власия. Освящение храма состоялось в 1892 году.
В 1930 году церковь была закрыта, и в её здании разместился сельский клуб. Во время Великой Отечественной войны храм был практически разрушен в результате бомбардировок.
В начале XXI века, в рамках программы строительства новых храмов в Москве, было принято решение о восстановлении православного храма в Братееве. В 2013 году на месте разрушенного храма был установлен закладной крест, а зимой 2013–2014 годов началось строительство деревянной церкви в честь преподобной Марии Египетской. Первая литургия в новом храме состоялась 19 сентября 2013 года, а 6 апреля 2014 года было совершено его малое освящение.
Параллельно с этим, в 2014 году началось строительство каменного храма в честь Чуда Архангела Михаила в Хонех. Проект храма был разработан по образцу церкви в Лесосибирске. Храм представляет собой крупное кирпичное однокупольное здание с тремя престолами и отдельно стоящей колокольней, выполненной в формах московской колокольни Ивана Великого. Строительство осуществлялось на пожертвования благотворителя М. Ю. Абрамова.
