3 мая 1872 года на территории скита Вознесенского монастыря была заложена деревянная церковь во имя Архангела Михаила, а также братские кельи. 27 июня 1876 года состоялось освящение храма, что ознаменовало начало его полноценного функционирования. Церковь стала важным духовным центром для жителей Иркутска, предоставляя место для богослужений и религиозных обрядов.
В 1938 году, в период антирелигиозной политики советской власти, церковь была закрыта. Однако 23 мая 1944 года храм вновь открыл свои двери для прихожан, став одним из немногих действующих православных храмов в регионе в то время.
7 января 1998 года при храме начал издаваться православный вестник «Верую!», ставший важным информационным ресурсом для верующих. Последний номер газеты вышел в мае 2020 года, после чего издание было прекращено.
Архитектурно Михаило-Архангельская церковь представляет собой образец деревянного зодчества XIX века. Здание выполнено в традиционном для того времени стиле, характеризующемся простотой форм и отсутствием излишней декоративности. Фасады украшены резными элементами, отражающими мастерство сибирских зодчих.
