Впервые населённые пункты Большое Дно и Малое Дно упоминаются в новгородских писцовых книгах XVI века. В документах 1552–1553 годов Дно названо сельцом, в котором стояла деревянная церковь Архангела Михаила. Владельцем сельца был князь Михаил Константинович Засекин. В XVIII веке здесь находились владения дворянского рода Ададуровых.
Каменная церковь в селе Дно была построена в 1752 году Василием Евдокимовичем Ададуровым (1709–1780). Василий Евдокимович получил образование в гимназии при Московском университете, в 1731 году издал «Латино-немецко-русский лексикон с краткой русской грамматикой», а в 1733 году стал первым русским адъюнктом по математике. В 1744 году ему было поручено преподавать русский язык будущей императрице Екатерине II.
Его сын, Василий Васильевич Ададуров (1765–1845), в 1781 году поступил подпрапорщиком в лейб-гвардии Преображенский полк, участвовал в войне со шведами в 1788–1790 годах. В 1800 году генерал-майор В. В. Ададуров был уволен в отставку Павлом I. В 1812 году вступил в Петербургское ополчение, с мая 1813 года командовал всем ополчением. За заслуги на полях сражений награждён золотой шпагой с алмазами, орденами Святой Анны 1-й степени, Святого Владимира 3-й степени.
Ныне существующая Михайловская церковь была построена генерал-майором В. В. Ададуровым на собственные средства в память об однополчанах, погибших в боях с французами. Строительство началось в 1818 году, а в 1825 году церковь была освящена. Храм является трёхпрестольным: главный престол – во имя Архангела Михаила, придельные – во имя Пророка Илии и Мучеников Флора и Лавра. Каменная колокольня соединена с храмом и первоначально имела девять колоколов различного веса.
В конце XIX – начале XX века через село Дно прошла линия Московско-Виндаво-Рыбинской железной дороги, что способствовало развитию населённого пункта. В этот период церковь посещали епископы Псковские и Порховские: Антонин (Державин) в 1898 году и Сергий (Ланин) в 1902 году. Они совершали молебны и обращались с поучениями к прихожанам.
В 1900 году в приходе действовали пять деревянных часовен в различных деревнях. При церкви не было церковно-приходского попечительства и богадельни. Двухклассная церковно-приходская железнодорожная школа при станции Дно была учреждена в 1899 году, в ней обучалось 179 мальчиков и 152 девочки. В селе Дно также работали две земские школы, одна с 1876 года, другая с 1905 года.
Штат церкви по состоянию на 1876 год включал священника и двух псаломщиков. С 1891 до 1906 года служил священник Александр Михайлович Белявский, с 1906 года – священник Александр Васильевич Архангельский. В разные годы в церкви служили дьяконы Николай Васильевич Дворицкий и Гавриил Николаевич Знаменский, псаломщик Василий Николаевич Никольский.
В 1900 году приход включал несколько деревень, а к 1914 году – село Дно, посёлок Дно и ряд деревень, с общим населением 1445 мужчин и 1414 женщин.