Инициатива строительства храма возникла в начале 2000-х годов в связи с необходимостью создания православного духовного центра вблизи Балтийского федерального университета имени Иммануила Канта. Первоначально планировалось освятить храм в честь святой мученицы Татианы, покровительницы студентов, однако в процессе строительства было принято решение посвятить его святому благоверному князю Александру Невскому, имя которого носит улица, на которой расположен храм .
Проект храма был разработан архитектором Алексеем Мусиным. Строительство началось в 2006 году после получения соответствующих разрешений от администрации города Калининграда. К 2008 году были завершены работы по подготовке строительной площадки, включая очистку территории, рытьё котлована и формирование свайного поля под фундамент здания .
20 июля 2008 года митрополит Смоленский и Калининградский Кирилл освятил закладной камень в основание храма, что ознаменовало официальное начало строительства. В течение последующих лет велись строительные работы, и 16 ноября 2013 года состоялось малое освящение храма, проведённое патриархом Московским и всея Руси Кириллом .
Архитектурно храм представляет собой пятиглавое здание с центральной главой, расположенной на шатре. Основные размеры храма составляют: длина — 38 метров, ширина — 20 метров, высота главного купола — 41 метр. Стиль архитектуры сочетает традиционные элементы русского церковного зодчества с современными строительными технологиями .
Внутреннее убранство храма включает росписи и иконостас, выполненные в соответствии с канонами православной церкви. Храм вмещает около 900 человек, что делает его вторым по величине православным храмом в Калининградской области .
С момента открытия храм активно функционирует, являясь центром духовной жизни для прихожан и студентов близлежащего университета. Он относится к Успенскому благочинию Калининградской епархии Русской Православной Церкви.
