Первое упоминание о церкви на этом месте относится к 1697 году, когда стольник Квашнин-Самарин построил деревянный храм во имя Богоявления Господня в своей усадьбе Брыково. В 1752–1754 годах владельцы усадьбы, представители рода Квашниных-Самариных, инициировали строительство нового каменного храма на месте старого деревянного. В 1876 году к церкви была пристроена трапезная с приделами во имя святителя Николая Чудотворца и пророка Божия Илии, а в 1877 году — четырёхъярусная колокольня.
Архитектурно храм представляет собой кирпичное сооружение в стиле барокко с элементами классицизма. Основной объём храма — двусветный четверик с пятигранной апсидой, увенчанный одной главой. Фасады украшены пилястрами и наличниками с декоративными элементами. Колокольня, построенная в 1877 году, имеет четыре яруса и завершена шпилем.
В начале 1930-х годов, в период гонений на церковь, храм был закрыт и использовался под машинно-тракторные мастерские и кузницу. Во время Великой Отечественной войны здание пострадало, а в 1970-х годах была разрушена крыша и завершения, проломлены и обрушены своды трапезной.
В 1989 году были проведены консервационные работы, направленные на предотвращение дальнейшего разрушения храма. В 1996 году здание было возвращено Русской Православной Церкви, после чего начались восстановительные работы.
