Село Верховлянь, расположенное на правом берегу реки Осёнка, известно с XVIII века. Изначально в селе существовала деревянная церковь, перенесённая в 1793 году из другого села Коломенского уезда. Однако со временем деревянный храм был утрачен, предположительно в результате пожара, что было нередким явлением для деревянных построек того времени.
В 1874 году на средства отставного майора Николая Ивановича Авдулова, проживавшего в соседнем селе Васьково, было принято решение о строительстве нового каменного храма в честь Рождества Пресвятой Богородицы. Строительство велось под руководством временного коломенского купца Григория Купавина.
Архитектурно храм выполнен в стиле эклектики с использованием мотивов древнерусского зодчества. Основной объём завершён восьмигранным световым барабаном с куполом. Колокольня на квадратном основании имеет восьмигранный ярус звона. Окна и детали декора украшены имитацией белого камня, внешне схожего с натуральным. На окнах сохранились чугунные решётки с растительным орнаментом.
Внутри храма сохранились старинные фрески на сводах, между окон, на колоннах и в алтаре. Особый интерес представляет хорошо сохранившаяся роспись размером около 3 на 4 метра, изображающая Воскресение Христово.
В 1900 году при храме была открыта церковно-приходская школа. В 1904 году храм был реконструирован, и изначально холодный храм стал отапливаемым.
С приходом советской власти в 1930-х годах начались гонения на церковь. Храм был закрыт и передан для нужд колхоза. В его здании разместили моторно-тракторную станцию, для чего были разрушены северная и южная стены основного объёма, чтобы облегчить заезд техники. Несмотря на это, фрески на стенах и столпах храма сохранились до наших дней.
В начале 1990-х годов начались попытки восстановления храма. Была организована приходская община, начат поиск средств на реставрацию. С 2016 года к работам по возрождению храма подключился московский автоклуб "Магистраль". За прошедшее время практически полностью завершены работы по консервации здания, поддерживается порядок в храме и на прилегающей территории, а главное — в храме проводятся богослужения.
