Село Троице-Лобаново, ранее известное как Маковец, упоминается в исторических документах с XVI века. В 1578 году в писцовых книгах Московского государства отмечено существование в селе деревянной церкви во имя Святой Троицы. Впоследствии, при царе Алексее Михайловиче и патриархе Иосафе II, на месте обветшавшего деревянного храма была возведена каменная церковь с двумя приделами — Успенским и Никольским.
В 1767 году, при владельцах села князьях Волконских, была построена каменная колокольня, что значительно обогатило архитектурный облик храма. В XVIII веке верх храма был перестроен и увенчан восьмериком с сомкнутым сводом. В 1837 году с западной стороны к церкви пристроили обширную трапезную, а также заново воздвигли среднюю апсиду. В 1843 году территория вокруг храма была обнесена оградой с кирпичными башнями и святыми воротами, что придало комплексу завершённость и монументальность.
Интересен факт, связанный с колоколом храма. По преданию, князь Лобанов-Ростовский привёз колокол с изображением шведского короля Карла XI и установил его на колокольне. Однако мощный звук колокола напугал князя во время заутрени, и он приказал сбросить его в пруд. Спустя время, при очистке пруда, колокол был найден князем Волконским и вновь помещён на колокольню. Отмечалось, что звук этого колокола был слышен далеко вокруг, а вблизи был слишком резок из-за высокого содержания серебра.
В советский период, в 1930-е годы, храм был закрыт и подвергся разорению. Здание использовалось как зернохранилище, что привело к его частичному разрушению. Однако постановлением Совета Министров РСФСР № 624 от 4 декабря 1974 года храм, угловые башни и ограда с воротами были поставлены на государственную охрану как памятники архитектуры.
В 1992 году церковь была передана Московской епархии, после чего начались восстановительные работы. В 1999 году храм получил статус патриаршего подворья, а с ноября 2014 года является приходом Московской епархии. В настоящее время продолжаются ремонтные работы по восстановлению первоначального облика церкви.
Архитектурно Троицкий храм представляет собой кирпичное здание с белокаменными порталами, относящееся к группе вотчинных церквей годуновского круга. Древнее ядро храма составляет бесстолпный четверик с двумя одноглавыми приделами, перекрытыми крещатыми сводами. В XVIII веке на древнем основании был возведён восьмерик с сомкнутым сводом. Многоярусная каменная колокольня и обширная трапезная были добавлены в XVIII и XIX веках соответственно. От первоначальной отделки сохранились остатки белокаменных порталов и цоколей, а на приделах — нижний ярус кокошников.
