Село Чернцы известно с XVIII века и изначально носило название Чернцы-Воротынских, указывающее на связь с князьями Воротынскими. Расположенное на правом берегу реки Ухтохмы, село стало центром одноимённой волости Ковровского уезда Владимирской губернии. В XIX веке владельцами села были помещики Титов, Измайлова, Митьков и Детлова, каждый из которых вносил вклад в развитие и процветание населённого пункта.
В центре села, на крутом берегу Ухтохмы, расположена каменная церковь Троицы Живоначальной, построенная в 1780 году на месте прежнего деревянного храма. В 1833 году, благодаря усилиям помещика Титова и прихожан, в церкви были устроены два придела: в честь Владимирской иконы Божией Матери и в честь Архистратига Михаила. Комплекс включал в себя храм, трапезную, колокольню и ограду, все здания были кирпичными и побелёнными. В церкви хранился крест с частицами мощей святых угодников, вставленный в икону; этот дар был преподнесён помещиком Титовым. Возле храма росло множество кустов сирени, придающих особый колорит окружающему пейзажу.
В 1930-е годы церковь была закрыта, и её помещения использовались для хозяйственных нужд, таких как гараж, водонапорная башня и магазин. В результате этих преобразований здание пришло в упадок, утратило внутреннее убранство, а икона с крестом были утеряны. Существует предание, что икона с мощами была закопана в церковной ограде, однако её местонахождение до сих пор неизвестно.
Летом 2000 года началась восстановление храма на средства местных предпринимателей. В процессе реставрации использовались материалы из школьного музея, что позволило сохранить историческую преемственность и связь поколений. Восстановлённый храм стал подворьем Николо-Шартомского монастыря, и в нём были возобновлены регулярные богослужения.
Архитектурно церковь представляет собой каменное здание с трапезной и колокольней, выполненное в стиле позднего барокко с элементами классицизма. Внешний декор включает пучки тонких колонок с кубоватыми капителями, поддерживающих широкий карниз с зубчиками. На боковых фасадах выделяются рельефно выступающие колончатые наличники окон, завершённые полуциркульными кокошниками. Колокольня, соединённая с основным зданием коротким притвором, увенчана восьмигранным шатром с килевидными кокошниками, подчёркивающими её вертикальность и изящество.
