Земли на левом берегу реки Яблоновой, притока Ольховой, в 1763 году приобрел полковник Василий Иванович Иловайский. Основанный им хутор получил название в честь деда — Макея Иловайского. В 1784 году по инициативе Иловайского началось строительство деревянного храма во имя Покрова Пресвятой Богородицы. Строительство завершилось в 1794 году. Храм имел один престол, колокольню и каменную ограду с деревянным частоколом. По штату 1839 года причт состоял из трех священников, двух диаконов и шести причетников.
13 апреля 1894 года во время пасхальной службы храм сгорел, сохранились лишь колокольня, трапезная и фундамент. В том же году попечительский совет обратился в Донскую духовную консисторию с просьбой разрешить строительство пристройки к уцелевшим частям. Новый храм возвели с двумя престолами: главным — в честь Покрова Пресвятой Богородицы и дополнительным — во имя святых Хрисанфа и Дарьи. Освящение престолов состоялось в 1901-1905 годах.
В 1928 году храм был закрыт, в 1953 году временно открыт, а в 1960 году вновь закрыт и переоборудован под школьный спортзал. В 1989 году здание возвращено верующим. Первые богослужения совершал игумен Паисий (Павлов). В 1995 году приход преобразован в Свято-Покровский скит, а в 2004 году указом Священного Синода РПЦ скит получил статус мужского монастыря.
В 2004 году архиепископ Ростовский и Новочеркасский освятил Покровский источник, расположенный близ монастыря. По преданию, источник появился в конце XVIII века одновременно со строительством первого храма. В 2018 году на территории обители освящен зимний храм в честь великомученика Георгия Победоносца.