Сурский Иоанно-Богословский женский монастырь был основан в 1899 году как женская община по инициативе протоиерея Иоанна Сергиева (св. Иоанна Кронштадтского), уроженца села Сура. В ноябре 1900 года указом Архангельской духовной консистории община была преобразована в заштатный общежительный женский монастырь. Первоначально на территории обители были построены деревянный храм во имя апостола и евангелиста Иоанна Богослова и монашеские кельи.
В 1907 году монастырь получил подворье в Архангельске, освященное в каменном здании. Кроме того, Иоанновский монастырь в Санкт-Петербурге изначально создавался как подворье Сурской общины. В 18 верстах от монастыря располагался Троицкий скит с деревянным храмом во имя Святой Троицы. Монастырь занимался благотворительной деятельностью, содержал школу и больницу для местного населения.
В 1920-х годах монастырь и его подворья были закрыты советской властью. Здания обители использовались не по назначению; Никольский собор, построенный при участии Иоанна Кронштадтского в 1891 году, был разрушен. В 1994 году началось возрождение монашеской жизни: в Архангельске была создана женская община, позже переведенная в деревню Ершовка. В 2012 году Священный Синод Русской Православной Церкви постановил открыть Сурский Иоанновский женский монастырь в селе Сура.
Архитектурный комплекс монастыря включал в себя каменную ограду, колокольню, деревянную домовую церковь, сестринские корпуса и хозяйственные постройки. Сохранившиеся здания постепенно восстанавливаются, включая Никольский собор, реконструкция которого началась в 2003 году.