Приход в честь Преображения Господня был основан в 1991 году. Между 1992 и 1995 годами на этом месте был построен храм.
В 2008 году, с учреждением Джанкойской епархии, Преображенский храм получил статус второго кафедрального собора епархии.
1 апреля 2015 года решением Священного Синода Украинской Православной Церкви на базе прихода собора был образован мужской монастырь в честь Преображения Господня.