Храм святителя Николая Чудотворца в селе Пресногорьковка является старейшим православным храмом Костанайской области. Строительство первой деревянной церкви на этом месте началось в 1766 году по распоряжению Тобольской духовной консистории. Освящение храма состоялось в 1792 году. Здание было возведено из сосны Красного леса, произраставшего на берегу Горького озера. В 1798 году деревянный храм полностью сгорел.
В 1801 году началось строительство каменного храма, завершенное к 1805 году. Церковь имела два придела: летний во имя Казанской иконы Божией Матери и зимний во имя святителя Николая Чудотворца. Архитектурный стиль сооружения сочетает элементы московского узорочья, украинских, среднерусских и северорусских традиций, что характерно для сибирского барокко. Строительство велось местными мастерами, имевшими опыт возведения храмов вдоль реки Исети.
В 1917 году имущество храма было конфисковано, а настоятель Василий Преображенский расстрелян. В 1938 году храм закрыли и преобразовали в зернохранилище. В 1940-х годах была разрушена колокольня, а с южной стороны сделана пристройка для клубной сцены. С 1957 по 1983 годы здание использовалось как пожарная часть.
В 1991 году храм возвращен Русской Православной Церкви. На территории церковного кладбища сохранились захоронения XIX века, включая могилу начальника Омского областного управления генерал-лейтенанта В.И. де Сент-Лорана, скончавшегося в 1835 году.