Первое известное упоминание о храме в селе Селинском относится к 1624 году, когда в писцовых книгах зафиксирована деревянная церковь Преображения Господня с приделом святителя Николая Чудотворца. Церковь была построена на средства местных вотчинников и являлась центром духовной жизни села.
В 1823 году, по инициативе майора Николая Маслова, началось строительство нового каменного храма на месте обветшавшей деревянной церкви. Строительство продолжалось восемь лет и было завершено в 1831 году. Новый храм был освящён в честь Преображения Господня, с двумя приделами: в честь Казанской иконы Божией Матери и святителя Николая Мирликийского.
Архитектурно храм выполнен в стиле ампир. Он представляет собой одноапсидный бесстолпный куб со световой купольной ротондой. По бокам основного объёма расположены портики дорического ордера с сужающимися кверху колоннами. К основному храму пристроена невысокая трапезная с приделами, к которой примыкает трёхъярусная колокольня с невысоким барабаном и главкой. Колокольня украшена пилястрами и треугольным фронтоном, состоит из трёх четвериков с большими арочными проёмами.
В 1880-х годах в храме был установлен главный резной позолоченный иконостас в четыре яруса. В приделах были размещены иконостасы конца XIX века.
В 1922–1923 годах священником храма был Алексей Воробьёв, впоследствии причисленный к лику святых как священномученик. Он был расстрелян 20 августа 1937 года на Бутовском полигоне.
В советский период храм, в отличие от многих других, не был закрыт и продолжал функционировать, за исключением непродолжительного времени в начале 1940-х годов. Это позволило сохранить его архитектурный облик и внутреннее убранство.
В начале XXI века были проведены реставрационные работы, направленные на восстановление первоначального облика храма. В 2005 году на колокольне были установлены новые колокола, приобретённые на средства, собранные жителями окрестных деревень.
