Село Ситне-Щелканово впервые упоминается в писцовой книге 1577 года как село Ситна на речке Ситенке. Название села имеет сложное происхождение: первая часть восходит к реке Ситне и имеет финно-угорские корни, вторая часть, вероятно, связана с именем ордынского баскака Щелкана (Чол-хана), убитого в Твери в 1327 году во время восстания против татар.
В 1834 году прихожане деревянной церкви Покрова Пресвятой Богородицы обратились к митрополиту Московскому Филарету с прошением о назначении к ним священника.
В начале XX века в селе был построен каменный храм Покрова Пресвятой Богородицы с двумя приделами: во имя святителя Николая Мирликийского и иконы Божией Матери «Утоли моя печали». Архитектурно храм выполнен в стиле, характерном для того времени, с элементами, напоминающими Благовещенскую башню Московского Кремля.
В 1930-х годах, в период гонений на церковь, храм был закрыт. Колокольня и часть здания сохранились, однако внутреннее убранство было утрачено.
В конце XX — начале XXI века начались работы по восстановлению храма. Благодаря усилиям местных жителей и прихожан, храм был частично восстановлен и вновь открыт для богослужений.
