Деревня Буняково, расположенная на берегах реки Малой Северки (Гнилуши), известна с XVI века. В конце XVI века сельцо Буняково принадлежало князю Ивану Юрьевичу Лобанову-Ростовскому, известному воеводе того времени. Впоследствии село переходило во владение различных знатных родов, включая князей Звенигородских и Долгово-Сабуровых.
В 1748 году владелица села, Настасья Фёдоровна Медведева, построила в Буняково деревянную церковь во имя Покрова Пресвятой Богородицы, после чего деревня получила статус села и стала именоваться «село Покровское, Буняково тож».
В начале XIX века село перешло во владение княгини Анастасии Ивановны Несвицкой. В 1809 году она инициировала строительство каменного храма в честь Покрова Пресвятой Богородицы, который был освящён в 1817 году. Здание церкви выполнено из белого тесаного камня в стиле зрелого классицизма. Основу его трёхчастной объёмно-пространственной структуры составляет одноапсидный храм с боковыми компартиментами и купольной ротондой, опирающейся на угловые пилоны. С запада к нему примыкают обширная двухпридельная трапезная и стройная трёхъярусная колокольня, некогда завершённая шпилем.
Храм имеет три престола: главный — в честь Покрова Пресвятой Богородицы, левый — во имя святителя Николая Чудотворца, правый — во имя святителя Димитрия Ростовского.
В 1935 году, в период антирелигиозной политики советского государства, храм был закрыт, а его здание использовалось для хозяйственных нужд, что привело к утрате многих элементов внутреннего убранства и архитектурных деталей.
В 1991 году храм был возвращён Русской Православной Церкви и начались работы по его восстановлению. Благодаря усилиям прихожан и местных жителей, здание было отреставрировано, и в нём возобновились богослужения.
В настоящее время Покровский храм в Буняково является действующим и относится к Домодедовскому благочинию Московской епархии. При храме ведётся активная приходская жизнь, организуются духовно-просветительские мероприятия и социальные проекты.