В начале XVII века село Алексино являлось дворцовым и принадлежало митрополиту Сарскому и Подонскому Киприану. Однако в период Смутного времени церковь в селе была уничтожена, и по данным 1627 года на её месте оставалось лишь церковное место. В 1653 году митрополит Серапион получил жалованную грамоту на село Алексино и восстановил церковь. Первое упоминание о новой церкви относится к 1676 году, когда в приходной окладной книге Патриаршего Казённого Приказа значится церковь Покрова Богородицы в вотчине митрополита Сарского и Подонского в селе Алексино.
В 1678 году в селе Алексино числились митрополичий дом и 11 крестьянских дворов, а церковь Покрова Пресвятой Богородицы продолжала функционировать. В 1779 году была построена новая деревянная церковь, которая просуществовала до 1826 года. В этом же году, благодаря усердию прихожан, был возведён каменный храм, существующий в Алексино и поныне. В этом храме было три престола: главный — в честь Покрова Пресвятой Богородицы, и два придела — в честь Святой Живоначальной Троицы и святого Димитрия Ростовского.
Архитектурно храм выполнен в стиле провинциального классицизма. Здание каменное, оштукатуренное и окрашенное в желтый цвет, с железной крышей. Главный купол обит английской жестью, кресты деревянные, обитые такой же жестью. Колокольня каменная, покрыта железом, со шпилем, обитым английской жестью.
Особенностью Покровского храма является то, что он никогда не закрывался, даже в сложные периоды российской истории. Он выстоял во время Отечественной войны 1812 года и не пострадал в годы Великой Отечественной войны. У стен храма было захоронение немецких солдат, погибших в этой местности, однако позже их останки были перезахоронены в Германии. В советское время, когда многие церкви закрывались, Покровский храм оставался единственным действующим в Можайском районе, и в нём регулярно совершались богослужения. При храме действует приход, проводятся регулярные богослужения и церковные мероприятия.
