Село Лужки упоминается в исторических источниках с XV века. В первой половине этого столетия здесь уже существовала церковь Святителя и Чудотворца Николая Мирликийского. Однако в 1571 году, во время нашествия крымского хана Девлет Гирея, эта церковь была сожжена. К 1655 году местная община восстановила храм.
В 1730 году Аграфена Ладыгина, вдова стольника, подала прошение о строительстве нового храма в Лужках во имя Святых Апостолов Петра и Павла. Строительство было завершено душеприказчиком Ладыгиной, статским советником Кропотовым. 6 сентября 1734 года церковь типа «восьмерик на четверике» была освящена.
В 1842 году к храму была пристроена трапезная часть с целью устройства двух приделов: Николая Мирликийского и Александра Свирского. Во время нашествия Наполеона в 1812 году Лужки пострадали: было сожжено несколько домов, однако сам храм остался целым и не был осквернен.
После революции 1917 года храм был закрыт, подвергся частичному разграблению и разрушению. В 1996 году богослужения были возобновлены, и началась реконструкция храма. В 1999 году в храм была возвращена икона-образ архиепископа Черниговского Феодосия Углицкого.
Архитектурно, храм представляет собой типичное для своего времени сооружение. Высокая колокольня с цилиндрическим ярусом звона и трапезная были пристроены в первой части XIX века. Внутри здания первоначальная отделка не сохранилась, что связано с его многократными перестройками и утратами.
