В 1915–1916 годах на средства владельцев дач в посёлке Ильинский была построена деревянная церковь во имя святых апостолов Петра и Павла. Проект храма разработал архитектор Семён Барков. Церковь стала важным духовным центром для местных жителей и дачников.
В 1928 году, в период гонений на церковь, храм был полностью разрушен, а на его месте организовали рынок. Долгое время верующие посёлка были лишены возможности собираться для совместных богослужений.
В начале 1990-х годов, с началом духовного возрождения в России, было принято решение о восстановлении храма. Митрополит Крутицкий и Коломенский Ювеналий назначил настоятелем прихода иерея Павла Жилина, который начал активную деятельность по возрождению прихода. Изначально было реконструировано здание бывшего продуктового магазина № 17, которое преобразовали в храм, освящённый в честь Введения во храм Пресвятой Богородицы. Архиерейское освящение состоялось 14 июля 1996 года. Этот храм используется для повседневных служб, крещений и отпеваний прихожан.
После начала богослужений во Введенском храме отец Павел приступил к строительству основного каменного храма во имя святых апостолов Петра и Павла с нижним храмом в честь святого пророка Божия Илии. К концу 1999 года завершились работы по строительству нижнего храма, и архиепископом Можайским Григорием было совершено его архиерейское освящение.
23 сентября 2003 года скончался основатель, строитель и первый настоятель прихода священник Павел Жилин. Указом митрополита Крутицкого и Коломенского Ювеналия настоятелем прихода в посёлке Ильинском был назначен протоиерей Димитрий Фёдоров.
Строительство храма Петра и Павла продолжилось и было завершено в 2010 году установкой пяти куполов с крестами. В 2015 году завершились отделочные работы, продолжалась фресковая роспись, планировалось строительство большой колокольни. 12 июля 2016 года, на престольный праздник святых первоверховных апостолов Петра и Павла, состоялась первая литургия в верхнем храме.
Петропавловский храм представляет собой двухэтажное пятикупольное сооружение в форме креста с боковыми порталами. Площадь каждого этажа превышает 1000 м², общая высота храма по вершине креста главного купола составляет более 40 м. Нижний храм посвящён святому пророку Божию Илии, с боковыми приделами в честь святого праведного Иоанна Кронштадтского и святого благоверного князя Александра Невского. Верхний храм освящён в честь святых первоверховных апостолов Петра и Павла, с приделами в честь святой блаженной Ксении Петербургской и Собора новомучеников и исповедников Российских.
5 августа 2018 года главный алтарь верхнего храма, два его придела и два придела нижнего храма были торжественно освящены митрополитом Крутицким и Коломенским Ювеналием при участии епископа Зарайского Константина и епископа Луховицкого Петра, а также множества священников.
В настоящее время богослужения по воскресеньям и праздникам в тёплое время года проводятся в летнем Петропавловском (верхнем) храме, а в зимний период — в тёплом Ильинском (нижнем) храме. Службы совершаются ежедневно, утром и вечером.
При храме действует воскресная школа и общество трезвости для алкогольно- и наркозависимых, а также их родственников. Приход ведёт благотворительную программу помощи социальным объектам Московской области и богадельням при монастырях Московской епархии.
