В конце 1990-х годов в Пушкино возникла необходимость в создании храма при Центральной районной больнице (ЦРБ). Идея строительства принадлежала настоятелю храма Боголюбской иконы Божией Матери города Пушкино протоиерею Иоанну Клименко. Получив благословение митрополита Крутицкого и Коломенского Ювеналия, в 2000 году началось возведение больничного храма. В это время в Россию была принесена честная глава великомученика и целителя Пантелеимона, что предопределило выбор небесного покровителя для нового храма.
Летом 2000 года стены храма были возведены под крышу. С этого момента клирики Боголюбской церкви начали совершать в новом храме литургии. За два года сформировалась община, состоящая из врачей, бывших пациентов и жителей близлежащих домов, что послужило основанием для создания самостоятельного прихода. В апреле 2002 года храм во имя великомученика и целителя Пантелеимона был отделён от Боголюбской церкви, а в мае того же года назначен настоятель.
26 апреля 2002 года были освящены и установлены купола на обоих приделах храма. После Пасхи 2002 года началось строительство колокольни. Первоначальная площадь храма составляла 67 квадратных метров, что со временем потребовало расширения из-за увеличения числа прихожан. В 2006 году была сооружена северная пристройка, увеличившая храм на 50 квадратных метров. В 2007 году началось строительство южной пристройки, с целью доведения общей площади храма до 350 квадратных метров.
Архитектурно храм представляет собой кирпичное здание с одним куполом и колокольней, выполненное в традициях православного зодчества с элементами классицизма. Фасады украшены декоративными элементами, характерными для храмовой архитектуры. Внутреннее убранство включает иконостас, росписи и другие элементы церковного искусства.
С момента основания храм активно участвует в духовной и социальной жизни города. При храме действует воскресная школа для детей и взрослых, где проходят занятия по изучению Священного Писания. Священнослужители регулярно совершают таинства и проводят беседы в больничных палатах, оказывая духовную поддержку пациентам и медицинскому персоналу. Ежедневно в храме совершаются утреня и божественная литургия, а каждую субботу — общее соборование.
Храм также занимается благотворительной деятельностью. С 1999 года силами прихода открыта воскресная школа в детском приюте, создан хор, а в поселковой библиотеке открыт отдел православной литературы. Храм публикует в местной газете статьи о духовной жизни прихода и еженедельно размещает расписание богослужений.
